一套優良的除塵系統，須擁有一個使用的，易于掌握的清灰操作控制設施與其配合。合理正確的進行系統設計和控制需要對工廠工藝過程，和本除塵器的特征有一個全面的了解，以便控制調整適當，操作方便可靠。
      控制系統一般是控制除塵器的清灰設備的停止周期、振打起動時間長短，并使其按照規定的程序和自控程序進行。除塵器的自動程序清灰，特別是大型的除塵器，要配置_，并測量指示儀表的配合。在這里可以顯示出除塵器的裝配水平。
      除塵器的清灰控制大致可分為三種：
1、除塵器的定時清灰控制
經一段是假的間隔，對各室輪流進行清灰。需控制的參數是清灰周期、清灰時間（關進風閥時間、開振打設備的時間及開進風閥的時間）小室清灰次數及相應的卸灰時間。
定時清灰的優點是控制比較簡單，所需的儀器較少。缺點是清灰周期不易跟隨工況變化做相應的適當的調整，具有盲目性。
2、定總阻力上、下限清灰控制
測得整個除塵器阻力達到設定值上限時，接通繼電器，控制電動機構，按規定的操作程序，對所有袋室相繼進行清灰與卸灰，清完一個周期后，回檢總阻力是否小于設定下限值，是則蓋慶輝合格，繼續監測總阻力；否，則清灰不合格，還要接著繼續清灰，頂多允許連清三次，如連清三次都不合格，則報警器報警，數碼管顯示故障內容，需進行檢查處理。這種控制方法克服了前者整體上的盲目性，但是仍是把工況不同的甚至相同的個室內同等看待。
3、分室定阻力上、下限清灰控制
這實際上是測得的每室風量與總風量進行比較，諾某室的進風量與總風量的比值低于設定值下限，則該室進行卸灰、清灰。清完后回檢上訴的比值，達到設定值上限以上，則認為清灰合格，小于上限值則對該室在進行一次清灰，頂多允連清三次，諾無效，需要對該室進行相應的檢修。對其它室仍可繼續巡回檢測，該清灰照常清灰。這種清灰系統，克服了盲目性與平均主義，工況穩定，濾袋的使用壽命也較長，是合理的方法，但是也有不足之處，使用的儀器較多，控制也較為復雜。