旋風除塵器的結構型式，取決于含塵氣體的入口型式和除塵器內部的流動狀態。按照結構型式可以分為圓筒體、長錐體、旁通式和擴散式等；按氣體流動狀況可以分為切向反轉式旋風除塵器，軸向式旋轉除塵器。
旋風除塵器的入口型式對于改良除塵器性能，減小壓力損失有規定的影響。氣體入口型式一般分為兩種。進氣方向大致與除塵器軸線垂直，與筒體表面相切進入。含塵氣體進入后，在筒體部分旋轉向下，進入錐體到達錐體前，反轉向上，清潔氣體經排氣管引出。這是常見的切向返轉式旋風除塵器。進氣方向與除塵器軸線平行的，稱之為軸向式旋風除塵器。該除塵器利用導流葉片，使含塵氣體在除塵器內旋轉。其除塵效率比前者低，但處理量大。
切向返轉式旋風除塵器又分為直入式和蝸殼式。直入式入口管外壁與除塵器筒體相切；而蝸殼式入口管內壁與除塵器筒體相切。入口管外壁采用漸開線形式，漸開角為180°，270°及360°等。直入式進口設計與制造方便，性能穩定。蝸殼式入口增大進口面積容易，并因入口有一個環狀空間，使入口含塵氣流距離筒體外壁更近。這樣，即縮短了塵粒向筒壁沉降距離，又可減小入口氣流與內旋流間的相互干擾，對提高除塵器效率有利，但卻使除塵器體積有所增大。切向式入口的旋風除塵器，壓力損失約為1000Pa左右。
軸向式旋風除塵器，根據含塵氣體在除塵器內流動方式可分為直流式、反旋式兩類。軸向進入型式的除塵器，氣體旋轉時利用導流葉片進行的，葉片形狀有各種形式。與切向進入型相比，在同一壓力損失下，能處理三倍氣體量，且氣流分配均勻。因而主要用其組合成多管旋風除塵器，處理量大的含塵氣體，軸向進入式除塵器的壓力損失約為400-500Pa，除塵效率也較低。